禽糞便為主要原料的有機肥料成為農田抗生素污染的重要來源。用于預防和治療疾病的抗生素被廣泛用于畜牧業(yè)和水產業(yè)規(guī)?；B(yǎng)殖，但是這些抗生素約有60%～90%以原藥和代謝產物的形式進入動物糞便。規(guī)模化養(yǎng)殖的畜禽糞便一部分有的直接被施用于農田，有的發(fā)酵腐熟后用于生產商品有機肥料檢測、有機無機復混肥料。因四環(huán)素類抗生素(英文名為tetracyclines, 簡稱TCs)成本低廉、使用方便和副作用相對較小等特點，而成為一種常見的畜禽飼用抗生素，主要品種有土霉素、四環(huán)素、金霉素與強力霉素等。國內外研究表明，難降解、易吸附的TCs可以通過食物鏈傳輸，尤其是含四環(huán)素的人畜糞便作為有機肥料施用于設施農田時，可能導致抗生素隨食物鏈積累的風險。TCs在土壤中比較穩(wěn)定，并隨糞肥的不斷施入在土壤中累積，過量的抗生素進入環(huán)境中，對農田土壤、地表和地下水及生態(tài)系統(tǒng)中各類生物產生危害，并誘發(fā)和傳播各類抗生素耐藥細菌，對人類公共健康產生威脅。
